Чтобы убрать уведомление о непрочитанном комментарии, нажмите на значок комментариев: 

Затем, перейдите на объект для его прочтения (значок конверта в "Действиях) или выберите галочками нужные и, в выпадающем списке, отметьте их как прочитанные: